MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019751	AAC	2	6	117	122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296780
2	NC_019751	AAT	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296780
3	NC_019751	ATTT	2	8	242	249	25 %	75 %	0 %	0 %	428296780
4	NC_019751	TGA	2	6	265	270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296780
5	NC_019751	ATT	2	6	313	318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296780
6	NC_019751	ATT	2	6	321	326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296780
7	NC_019751	TGT	2	6	394	399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296780
8	NC_019751	AAT	2	6	407	412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296780
9	NC_019751	GCA	2	6	428	433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296780
10	NC_019751	TG	3	6	480	485	0 %	50 %	50 %	0 %	428296780
11	NC_019751	GTG	3	9	483	491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296780
12	NC_019751	GCAA	2	8	517	524	50 %	0 %	25 %	25 %	428296780
13	NC_019751	TGATT	2	10	595	604	20 %	60 %	20 %	0 %	428296780
14	NC_019751	TGA	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296780
15	NC_019751	AAG	2	6	711	716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296780
16	NC_019751	AGT	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296780
17	NC_019751	ACC	2	6	781	786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296780
18	NC_019751	A	6	6	925	930	100 %	0 %	0 %	0 %	428296780
19	NC_019751	ATT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296780
20	NC_019751	AT	3	6	1128	1133	50 %	50 %	0 %	0 %	428296780
21	NC_019751	GAT	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296780
22	NC_019751	CGT	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296780
23	NC_019751	GAA	2	6	1244	1249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296780
24	NC_019751	A	6	6	1308	1313	100 %	0 %	0 %	0 %	428296780
25	NC_019751	ATTA	2	8	1557	1564	50 %	50 %	0 %	0 %	428296781
26	NC_019751	ACC	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296781
27	NC_019751	GCTTTG	2	12	1681	1692	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428296781
28	NC_019751	TTG	2	6	1812	1817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296781
29	NC_019751	ATG	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296781
30	NC_019751	ACC	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296781
31	NC_019751	AGA	2	6	1953	1958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296781
32	NC_019751	ATG	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296781
33	NC_019751	TCA	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296781
34	NC_019751	A	6	6	2150	2155	100 %	0 %	0 %	0 %	428296781
35	NC_019751	TGC	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296781
36	NC_019751	TAA	2	6	2250	2255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296781
37	NC_019751	ATA	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296781
38	NC_019751	TCC	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296781
39	NC_019751	CGT	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296781
40	NC_019751	CCT	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296781
41	NC_019751	CAC	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296781
42	NC_019751	CAT	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296781
43	NC_019751	TGC	2	6	2415	2420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296781
44	NC_019751	AAT	2	6	2472	2477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296781
45	NC_019751	CCAT	2	8	2539	2546	25 %	25 %	0 %	50 %	428296781
46	NC_019751	AAT	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296781
47	NC_019751	CTT	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296781
48	NC_019751	GCT	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
49	NC_019751	T	6	6	2983	2988	0 %	100 %	0 %	0 %	428296782
50	NC_019751	GCTTG	2	10	2993	3002	0 %	40 %	40 %	20 %	428296782
51	NC_019751	T	7	7	3010	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	428296782
52	NC_019751	ATATTT	2	12	3050	3061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296782
53	NC_019751	ACA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296782
54	NC_019751	TTA	2	6	3179	3184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296782
55	NC_019751	TAT	2	6	3205	3210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296782
56	NC_019751	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
57	NC_019751	TGC	3	9	3304	3312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
58	NC_019751	TGC	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
59	NC_019751	TCG	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
60	NC_019751	CGT	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
61	NC_019751	ATCAAA	2	12	3401	3412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428296782
62	NC_019751	CGT	2	6	3606	3611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296783
63	NC_019751	ACC	2	6	3615	3620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296783
64	NC_019751	TAA	2	6	3656	3661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296783
65	NC_019751	TCG	3	9	3703	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296784
66	NC_019751	ACC	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296784
67	NC_019751	CAA	2	6	3830	3835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296784
68	NC_019751	TAG	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
69	NC_019751	TAG	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
70	NC_019751	TGA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
71	NC_019751	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296785
72	NC_019751	T	6	6	4342	4347	0 %	100 %	0 %	0 %	428296785
73	NC_019751	ATT	2	6	4402	4407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296785
74	NC_019751	CTG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296785
75	NC_019751	ACC	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296785
76	NC_019751	CTATG	2	10	4478	4487	20 %	40 %	20 %	20 %	428296785
77	NC_019751	TTGT	2	8	4495	4502	0 %	75 %	25 %	0 %	428296785
78	NC_019751	AGA	2	6	4530	4535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296785
79	NC_019751	ATCGCC	2	12	4686	4697	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428296785
80	NC_019751	GAC	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296785
81	NC_019751	CGT	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296785
82	NC_019751	CTA	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296785
83	NC_019751	GCA	2	6	4951	4956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296785
84	NC_019751	AC	3	6	5006	5011	50 %	0 %	0 %	50 %	428296785
85	NC_019751	TGA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
86	NC_019751	GTTG	2	8	5127	5134	0 %	50 %	50 %	0 %	428296785
87	NC_019751	TTAC	2	8	5185	5192	25 %	50 %	0 %	25 %	428296785
88	NC_019751	GAT	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
89	NC_019751	GATG	2	8	5536	5543	25 %	25 %	50 %	0 %	428296785
90	NC_019751	TAG	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
91	NC_019751	ATG	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
92	NC_019751	TGGC	2	8	5583	5590	0 %	25 %	50 %	25 %	428296785
93	NC_019751	CGC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296785
94	NC_019751	ACC	2	6	5662	5667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296785
95	NC_019751	GCG	2	6	5719	5724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428296785
96	NC_019751	ATAC	2	8	5784	5791	50 %	25 %	0 %	25 %	428296785
97	NC_019751	AAC	2	6	5868	5873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296785
98	NC_019751	CCG	2	6	5883	5888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296785
99	NC_019751	ATG	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
100	NC_019751	TTC	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296785
101	NC_019751	ATT	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296785
102	NC_019751	ATT	2	6	6185	6190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296785
103	NC_019751	ATTA	2	8	6210	6217	50 %	50 %	0 %	0 %	428296785
104	NC_019751	TTA	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296786
105	NC_019751	TAA	2	6	6593	6598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
106	NC_019751	TAAT	2	8	6742	6749	50 %	50 %	0 %	0 %	428296786
107	NC_019751	TCA	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296786
108	NC_019751	A	6	6	6803	6808	100 %	0 %	0 %	0 %	428296786
109	NC_019751	CAAA	2	8	6859	6866	75 %	0 %	0 %	25 %	428296786
110	NC_019751	CTAT	2	8	6882	6889	25 %	50 %	0 %	25 %	428296786
111	NC_019751	ATA	2	6	6912	6917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
112	NC_019751	TGCT	2	8	6944	6951	0 %	50 %	25 %	25 %	428296786
113	NC_019751	ATT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296786
114	NC_019751	TA	3	6	7049	7054	50 %	50 %	0 %	0 %	428296786
115	NC_019751	ATT	2	6	7088	7093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296786
116	NC_019751	ACT	3	9	7094	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296786
117	NC_019751	ATA	2	6	7117	7122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
118	NC_019751	CTC	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296786
119	NC_019751	CCA	2	6	7191	7196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296786
120	NC_019751	ATA	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
121	NC_019751	AGG	3	9	7280	7288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428296786
122	NC_019751	TAA	2	6	7328	7333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
123	NC_019751	TGC	2	6	7397	7402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296786
124	NC_019751	GAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296786
125	NC_019751	AAT	2	6	7455	7460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
126	NC_019751	T	6	6	7479	7484	0 %	100 %	0 %	0 %	428296786
127	NC_019751	TCT	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296786
128	NC_019751	AAG	2	6	7520	7525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296786
129	NC_019751	TCA	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296786
130	NC_019751	AT	3	6	7566	7571	50 %	50 %	0 %	0 %	428296786
131	NC_019751	CAA	2	6	7777	7782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296787
132	NC_019751	AGA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296787
133	NC_019751	T	6	6	7889	7894	0 %	100 %	0 %	0 %	428296787
134	NC_019751	TGA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296787
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